基因組學(xué)研究揭示鴿子多樣性的遺傳基礎(chǔ)及其起源歷史

      由美國猶他大學(xué)、深圳華大基因研究院等單位合作完成的鴿子基因組研究成果在《科學(xué)》(Science)雜志在線發(fā)表。該研究從分子層面揭示了家鴿的起源歷史,并發(fā)現(xiàn)了鴿子羽冠多樣性的遺傳基礎(chǔ),填補了鴿子研究的遺傳學(xué)空白。


      信鴿在戰(zhàn)爭年代因傳遞信息而留下種種佳話。而這種戰(zhàn)爭中的“傳令兵”,一開始是由原鴿馴化而來的。經(jīng)過眾多養(yǎng)鴿者的長時間馴化,已經(jīng)分化出諸多形態(tài)各異的鴿子,如球胸鴿、翻頭鴿等特色品種。雖然所有家鴿都是來源于一個物種,但它們在很多性狀上的差異比一些物種之間的差異還要大。家鴿這種廣泛的多樣性引起了諸多關(guān)注。例如,達爾文就曾花費大量時間和精力研究家鴿,并借助鴿子人工選擇的例子來闡述關(guān)于他所提出的自然選擇的相關(guān)理論。如今,得益于基因組學(xué)的快速發(fā)展,研究人員可以從分子層面對150年前激起達爾文興趣的家鴿多樣性進行深入分析。


      為了研究鴿子極其豐富的表型多樣性的遺傳學(xué)基礎(chǔ),研究人員對其中一個家鴿品種進行全基因組測序及組裝,并對另外36個家鴿品種以及2只野鴿(恢復(fù)野生習(xí)性的家鴿)進行了重測序。


      據(jù)悉,鴿子是目前為數(shù)不多的已完成測序的鳥類之一,其基因組與家雞、火雞、斑馬雀及虎皮鸚鵡的基因組一起,將為鳥類研究提供更多的線索。


      之前的研究提供了一些有限的證據(jù),發(fā)現(xiàn)部分家鴿起源于中東地區(qū),而另一些品種可能起源于印度,此外還發(fā)現(xiàn)野鴿和賽鴿之間存在一定的親緣關(guān)系;诖舜螠y序得到的大量基因組學(xué)數(shù)據(jù),研究人員發(fā)現(xiàn)伊朗地區(qū)的鴿子與印度的鴿子存在很多遺傳共性,這個研究結(jié)論也與歷史上這些地區(qū)之間的貿(mào)易往來相吻合。研究人員認(rèn)為,實際上主要的家鴿品種均起源于中東地區(qū)。此外,研究人員還分析了兩種野鴿的基因組數(shù)據(jù),一種是來源于美國鹽湖城地區(qū)的15州際公路立交橋附近的鴿子,另一種來源于美國弗尼吉亞州的安娜湖。雖然這兩種鴿子相隔1000英里,但它們在遺傳水平均與賽鴿品種非常相似,支持了野鴿種群主要來源于賽鴿的觀點。


      很多鳥類都有羽冠,羽冠是一種頭部的裝飾,在鳥類求偶過程中發(fā)揮著吸引異性的作用。通過全基因組群體分析,研究人員發(fā)現(xiàn)EPhB2(Ephrin受體B2)基因在鴿子的羽冠發(fā)育中起著開關(guān)基因的作用,該基因正常時,則沒有羽冠;而當(dāng)其攜帶發(fā)生突變的等位基因的純合子時,則形成羽冠。此外,研究人員還觀察到在所有具有羽冠的鴿子中,EPhB2基因及其附近區(qū)域的基因突變型都是相同的,這表明該性狀在鴿子進化歷史中僅出現(xiàn)了一次,然后通過雜交選育擴散到其它不同的品種中,而并非在不同品種中多次獨立進化。



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